WebApr 29, 2024 · 基因家族分析流程蛋白序列的blast比对候选蛋白序列的提取候选基因的保守结构域确定 此版本为无代码版本,依赖tbtools来实现,纯粹记录自己的学习经验。蛋白序列的blast比对 选择拟南芥基因家族的蛋白序列文件 选择你想要查找的基因家族的基因组蛋白文件 选择你要输出的文件名 选择输出格式 ... WebOct 7, 2024 · 写在前面: 非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲的很棒,可以试听。. 一共分为4个部分 TBtools基因家族分析详细教程(1) TBtools基因家族分析详细教程(2)基因家族成员的基本分析 TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析1 ...
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WebApr 5, 2024 · TBtools 这个子工具的功能,比较稳健和丰富。. 可以先看看界面的主要组成。. 待可视化的基因 ID 列表或者进化树 ,如果输入的是进化树,那么进化树也是有基因 ID 的,在程序逻辑上,跟 ID 列表区别不大。. TBtools 会使用这个基因 ID 列表,自动提取MEME,Domain ... WebAug 3, 2024 · A simplified BLAST wrapper that enables BLAST to be implemented in TBtools (Camacho et al., 2009) and allows sequence comparison on a local machine with optimized settings. In addition, functions facilitating the visualization and management of BLAST results are provided under this menu. marco rematore
NCBI BLAST比对结果详细分析 - 实验方法 - 丁香通
WebMar 27, 2024 · 根据Blast结果提取对应序列. 提取对应序列需要使用tbtools中的Fasta Extract功能。. image.png. 点击Sequence→Fasta tools→Fasta Extract … WebSep 4, 2024 · HMMER批量比对及结果处理. HMMER是基于隐马尔可夫模型序列比对工具,相较于blast,HMMER更为准确,尤其是在功能基因的研究方面,它可以更准确的检测到远的同源序列。. 自己的分析需要对一批数据进行hmmsearch,因此写了这个python脚本,用于批量hmmer比对及后续的 ... WebFeb 17, 2024 · 所以,提问之前,. 明确,遇到报错是新手常态 。. 尝试阅读,或者猜测可能出错原因 ,这里可能尽量尝试从报错信息中猜测,这个才是个人提升的主要过程。. TBtools 报错时,往往会弹出黑框。. 你可以基于黑框中的信息进行猜测。. 如果猜不出来,考虑来查 … marc orel meditation